Gijsbertus Derksen ging naar de Koninklijke Academie van Beeldende Kunsten in Den Haag en de Rijksakademie van beeldende kunsten in Amsterdam. Later had hij een eigen atelier in zijn huis, waar hij landschappen schilderde, meestal en-plein-air, in de Realistische, soms impressionistische stijl. Ook schilderde hij portretten. Derksen was lid van de kunstenaarsverenigingen Kunstenaarsvereniging Sint Lucas en Arti et Amicitiae in Amsterdam. Hij exposeerde zijn werk op de expositie 'Hollandse Levende Meesters' in 1907.